Secuenciación de genoma completo
Servicio WGS 30x para investigación y centros clínicos. Tecnología DNBSEQ, Q30>90% y entregables FASTQ/BAM/VCF listos para tus análisis.
Parámetros del servicio
Cobertura, calidad y entregables ajustados a los estándares internacionales de genómica de producción.
- PlataformaDNBSEQ-G400 y DNBSEQ-T7 (MGI/Complete Genomics) con tecnología DNB y química CoolMPS.
- Cobertura media30x en genoma humano (escalable a 15x, 60x o superior bajo demanda).
- Longitud de lecturaPaired-end 150 pb (PE150) estándar, PE100 disponible.
- Output por muestra>120 Gb de datos brutos, equivalente a >400 M reads.
- CalidadQ30 > 90%, duplicate rate < 10%, GC bias controlado.
- Input requeridoDNA genómico, mínimo 500 ng, A260/280 ≥ 1,8, A260/230 ≥ 2,0.
- Muestras aceptadasSangre EDTA K2, saliva, FFPE (con ajuste), ADN extraído.
- Turnaround4–6 semanas desde recepción a entrega de FASTQ.
De la muestra al FASTQ
Proceso integral bajo un mismo contrato. Control de calidad en cada etapa, trazabilidad completa y SLA garantizado.
Extracción
Extracción automatizada (columnas o magnéticas) con QC por Qubit, NanoDrop y TapeStation.
Librería
Preparación PCR-free o estándar según proyecto. Fragmentación enzimática o por ultrasonidos.
Secuenciación
DNBSEQ-G400 o T7 con química CoolMPS de baja tasa de error y alta homogeneidad.
Entrega FASTQ
Descarga por servidor SFTP cifrado o disco duro enviado por mensajería. Retención 6 meses.
Bioinformática llave en mano
Si tu grupo no tiene capacidad de cómputo o personal bioinformático, nos encargamos del análisis completo.
Alineamiento + BAM
BWA-MEM2 contra GRCh38 con tags secundarios, ordenado y deduplicado. Listo para análisis.
Variant calling
SNV e indels con DeepVariant o HaplotypeCaller (GATK4). CNV con CNVkit/GATK gCNV. SV con Manta/DRAGEN.
Anotación
VEP + SnpEff + ClinVar + gnomAD + OMIM + HPO. VCF anotado listo para filtrado.
Análisis trio
Filtrado por segregación, de novo, autosómico recesivo y X-linked. Ideal para enfermedades raras.
Interpretación ACMG
Clasificación de variantes candidatas con criterios ACMG/AMP explícitos, revisada por genetista.
Informe personalizado
Informe adaptado al objetivo del proyecto: clínico, farmacogenómico, poblacional, PRS, etc.
Descuentos por volumen
Precios decrecientes según número de muestras. Condiciones especiales para proyectos académicos y colaboraciones a largo plazo.
1–9 muestras
Proyectos piloto o estudios pequeños
- Extracción y librería
- Secuenciación DNBSEQ
- Entrega FASTQ
- Bioinformática opcional
10–49 muestras
Estudios de cohorte estándar
- Extracción y librería
- Secuenciación DNBSEQ
- Entrega FASTQ + BAM
- Project manager dedicado
- Bioinformática opcional
50+ muestras
Grandes cohortes y biobancos
- Condiciones personalizadas
- Entrega escalonada
- Almacenamiento extendido
- Soporte bioinformático
¿Tienes un proyecto en mente?
Escríbenos con los detalles (número de muestras, cobertura, entregables) y te enviamos presupuesto en 48 h.
