Microbioma intestinal humano (GutScreen)

Descripción

Secuenciación metagenómica shotgun del microbioma intestinal humano a partir de una muestra de heces. Caracteriza ~2.008 especies (bacterias, arqueas, hongos, parásitos y virus ADN), el resistoma completo (CARD, 4.500+ genes), los factores de virulencia y toxinas (VFDB) y el perfil funcional (HUMAnN3), todo con el mismo ADN y en un solo ensayo.

Incluye:

• Kit de recogida de muestra (tubo DNA/RNA Shield + espátula + sobre prefranqueado; envío al laboratorio incluido)
• Extracción de ADN + control de calidad
• Secuenciación shotgun PE150 (≥20 M lecturas, ~6 Gb por muestra) con eliminación de lecturas humanas (GRCh38)
• Bioinformática completa: Kraken2/Bracken + MetaPhlAn4 + HUMAnN3 + AMRFinderPlus + CARD + VFDB
• 8 índices clínicos: GMHI, GMWI2, DI V2, EDS, Butyrate Capacity, CRC Risk, IBD (CD/UC) y C. difficile Risk
• Triaje de severidad (HIGH / MODERATE / INFORMATIONAL) y detección de confusores farmacológicos (IBP, metformina, mesalazina, hierro oral)
• Stewardship antimicrobiano alineado con EUCAST 2025 / IDSA / SEIMC
• Informe clínico PDF en español (14 secciones) firmado por biólogo sanitario
• Consultoría clínica de interpretación y seguimiento longitudinal

Qué analiza:

• Perfil taxonómico (~2.008 especies) con enteropatógenos y patobiontes oportunistas
• Resistoma (CARD 4.500+ genes) y virulencia + toxinas (VFDB, 10 paneles)
• Hongos (micobioma), parásitos y virus ADN entéricos + fagos
• Perfil funcional (HUMAnN3): SCFA/butirato, ácidos biliares y vías MetaCyc

Plazo:

Hasta 30 días desde la recepción de la muestra en el laboratorio.

Muestra:

Heces frescas (2-5 g) en tubo con estabilizador DNA/RNA Shield (kit incluido). No requiere ayuno. Estable a temperatura ambiente hasta 30 días.

Herramienta de soporte a la decisión clínica; no constituye diagnóstico médico por sí sola. La detección de genes de resistencia no equivale a resistencia fenotípica (EUCAST 2025).