Descripción
Sequenciação metagenómica shotgun do genoma completo do microbioma intestinal humano a partir de uma amostra de fezes. Caracteriza ~2.008 espécies (bactérias, archaea, fungos, parasitas e vírus de ADN), o resistoma completo (CARD, mais de 4.500 genes), os fatores de virulência e toxinas (VFDB) e o perfil funcional (HUMAnN3), tudo a partir do mesmo ADN, num único ensaio.
Inclui:
- Kit de recolha da amostra (tubo DNA/RNA Shield + espátula + envelope pré-pago; envio para o laboratório incluído)
- Extração de ADN e controlo de qualidade
- Sequenciação shotgun PE150 (≥20 M leituras, ~6 Gb por amostra) com remoção das leituras humanas (GRCh38)
- Bioinformática completa: Kraken2/Bracken + MetaPhlAn4 + HUMAnN3 + AMRFinderPlus + CARD + VFDB
- 8 índices clínicos: GMHI, GMWI2, DI V2, EDS, Butyrate Capacity, CRC Risk, IBD (CD/UC) e C. difficile Risk
- Triagem de severidade (HIGH / MODERATE / INFORMATIONAL) e deteção de confundidores farmacológicos (IBP, metformina, mesalazina, ferro oral)
- Stewardship antimicrobiano alinhado com EUCAST 2025 / IDSA / SEIMC
- Relatório clínico PDF (14 secções) assinado por biólogo sanitário
Prazo:
Até 30 dias após a receção da amostra no laboratório.
Amostra:
Fezes frescas (2-5 g) em tubo com estabilizador DNA/RNA Shield (kit incluído). Não exige jejum. Estável à temperatura ambiente até 30 dias.
Ferramenta de apoio à decisão clínica; não constitui diagnóstico médico por si só. A deteção de genes de resistência não equivale a resistência fenotípica (EUCAST 2025).
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