Oncologia Lungo (Genoma)

Sospetta predisposizione ereditaria al cancro (mammella/ovaio, colon/Lynch, poliposi, endocrino, renale, feocromocitoma/paraganglioma, Li-Fraumeni, Cowden).

Geni analizzati (44 geni)

Riferimento: GRCh38, trascritti MANE Select.

Scarica l’elenco dei geni (PDF) — versione v1.0.

Copertura di disegno (genoma completo 30x PCR-free)

94.23% — copertura uniforme su genoma 30x (regioni a normale mappabilità)
n/a — nessun capture nel genoma: nessun fianco off-target
Gap di mappabilità (duplicazioni segmentali; vedi maschera GS) — intervalli da validare con profondità empirica o fill-in mirato.

Varianti incluse ed escluse

Incluse: SNV e indel in range riportabile (≥20x, sensibilità SNV-het 99%), CNV genomiche (metodo read-depth + split-read; confermate; escluse regioni segmentali senza validazione) + SV. Espansioni screenate con ExpansionHunter (≥10x) e confermate pre-referto. DNAmt non incluso in questo pannello.

Escluse: Mosaicismi <5% VAF; regioni a bassa mappabilità dichiarate.

limite dichiarato ≥5% VAF; mosaicismi di basso livello (p. es. NLRP3, dermatosi a mosaico) richiedono un percorso deep-amplicon mirato, non incluso di default.

Campione, tempi e prezzo

Campione: Sangue EDTA K2 o saliva · Tempi: 4–6 settimane · Prezzo: 500 € (genoma 30x).

Requisiti clinici

Consulenza genetica pre/post richiesta (non opzionale) trattandosi di test predittivo o su minore. Prescrizione medica richiesta e consenso informato specifico (inclusi reperti secondari ACMG SF v3.2 con opt-in/out e policy VUS). Consulenza genetica pre/post disponibile.

Limitazioni

Test germinale, non tumorale: non rileva mutazioni somatiche né guida la terapia oncologica. Geni candidati senza evidenza NCCN fuori dal referto clinico.

Ri-analisi

Versionamento annuale (Panel_oncologia_larga_v202609); ri-analisi disponibile con l’evolversi delle evidenze.

Il prezzo include conferme ortogonali, consulenza genetica e una ri-analisi annuale; ulteriori ri-analisi secondo tariffario vigente.

Guida alla richiesta oncoereditaria: vedi seno-ovaio/ginecologia per spettri ristretti.