Microbioma intestinal humano
Sequenciação metagenómica completa de uma amostra de fezes: taxonomia ao nível da espécie, resistoma, virulência, perfil funcional e 8 índices clínicos integrados num único relatório. Do dado à decisão clínica.
Um único ensaio, cobertura completa
A sequenciação shotgun do genoma completo microbiano supera as limitações da coprocultura, dos painéis PCR e da sequenciação 16S: não se limita a quem está, mas descreve o que faz e que risco acompanha.
Perfil taxonómico
~2.008 espécies bacterianas e arqueias (Kraken2/Bracken + MetaPhlAn4). Enteropatogénios (Salmonella, Shigella, Campylobacter, C. difficile, E. coli STEC/EIEC/ETEC) e patobiontes oportunistas.
Kraken2 · MetaPhlAn4Resistoma (AMR)
Genes de resistência a β-lactâmicos (blaKPC, blaNDM, blaOXA, blaCTX-M), vancomicina (vanA/B), colistina (mcr) e linezolida, entre outras classes.
CARD 2025 · AMRFinderPlusVirulência e toxinas
TcdA/TcdB e CDT de C. difficile, CPE e NetF de C. perfringens, toxina Shiga (Stx1/Stx2), toxina colérica, BFT/ETBF e cagA/vacA de H. pylori.
VFDB · 10 painéisPerfil funcional
HUMAnN3 (ChocoPhlAn + UniRef90): síntese de butirato e ácidos gordos de cadeia curta, metabolismo de ácidos biliares e vias MetaCyc.
HUMAnN3Fungos, parasitas e vírus
Micobioma (Candida, Aspergillus, Saccharomyces), protozoários (Giardia, Cryptosporidium, Blastocystis) e vírus ADN entéricos + fagos.
Para lá das bactériasÍndices + triagem clínica
8 índices clínicos com AUC publicada, triagem de severidade (HIGH/MODERATE/INFORMATIONAL) e deteção de confundidores farmacológicos.
GMHI · GMWI2 · EDS8 índices clínicos
Cada índice é reportado com o seu desempenho (AUC e IC 95%) para que o clínico saiba exatamente o que esperar.
GMHI · GMWI2
Índices de saúde do microbioma (Gupta 2020; Chang/Gupta 2024), validados em milhares de metagenomas de dezenas de países.
DI V2 · EDS
Dysbiosis Index (z-score, painel 8:2) e Enterotype Dysbiosis Score sobre 5 enterosignatures (Frioux 2023).
Butyrate Capacity
Capacidade butirogénica a partir de 7 géneros produtores (Vital 2017), com bandas de interpretação.
CRC Risk
Assinaturas de espécies enriquecidas em cancro colorretal (Piccinno/Segata 2025): triagem de priorização, não diagnóstico.
IBD CD vs UC
Scores independentes para doença de Crohn e colite ulcerosa (Zheng 2024).
C. difficile Risk
Abundância, toxinas e ambiente ecológico associado ao risco de recorrência (IDSA/SHEA 2024).
Quando está indicado?
Indicações claras
IBS-D / IBS-M refratário · caraterização CD vs UC · C. difficile recorrente (≥2 episódios) · suspeita de SIBO · disbiose pós-antibiótico com diarreia persistente >2 semanas · diarreia crónica com calprotectina normal e colonoscopia negativa.
Também recomendado
Rastreio de apoio em FIT+ com colonoscopia diferida · monitorização de resposta a FMT · avaliação pré-imunossupressão · apoio à predição de resposta a imunoterapia · síndrome metabólica / T2D e eixo intestino-cérebro.
Da amostra ao relatório
1. Recolha
Kit em casa: tubo DNA/RNA Shield + espátula. Fezes frescas (2-5 g), sem jejum.
2. Extração e QC
ADN total (ZymoBIOMICS), quantificação e controlo de integridade.
3. Sequenciação
Shotgun PE150, ≥20 M leituras (~6 Gb) com eliminação de leituras humanas (GRCh38).
4. Relatório
14 secções, índices clínicos, resistoma e recomendações. Assinado por biólogo sanitário.
Amostra e envio
Fezes frescas (2-5 g) em estabilizador DNA/RNA Shield (estável à temperatura ambiente até 30 dias). Envio com etiqueta UN3373, envelope pré-franquiado incluído. Sem fixadores.
Prazo e entrega
Relatório clínico PDF em até 30 dias desde a receção da amostra, descarregável a partir do portal. Inclui consultoria de interpretação e seguimento longitudinal.
Relatórios de exemplo
Relatórios reais anonimizados de diferentes perfis clínicos. Mesmo formato, mesmas secções e igual nível de detalhe que receberá.
Rastreio em cancro colorretal
Homem, 71 anos. Rastreio pré-decisão terapêutica; sem patogénios de prioridade alta e disbiose ligeira.
Relatório · PDFPerfil metabólico
Homem, 37 anos. Avaliação pré-intervenção em contexto metabólico com disbiose moderada-grave.
Relatório · PDFPerfil pediátrico
Homem, 12 anos. Avaliação pré-intervenção em contexto metabólico com disbiose ligeira.
Relatório · PDFRastreio de dador de FMT
Homem, 32 anos. Veredicto “NÃO APTO”: deteção de patogénios que excluem a doação.
Relatório · PDFColite ulcerosa em atividade
Mulher, 37 anos. Monitorização de atividade; a clínica inflamatória prevalece sobre a disbiose ligeira.
Relatório · PDFDo dado bruto à decisão clínica
Um único ensaio de fezes: taxonomia, resistoma, virulência, perfil funcional e índices clínicos integrados.